Филиппинцы считают природу своим народным достоянием и тщательно охраняют ее. Значительная часть флоры и фауны та же, что и в Африке. В список животных, подвергающихся опасности вымирания, внесены 108 живущих на Филиппинах видов африканских животных. На Филиппинах живет и филиппинский крокодил-людоед, и дьюгонг – морская корова.
На острове Бохоль можно увидеть тарсиеру, самую маленькую обезьянку в мире. У подножия вулкана Майон расположен парк живой природы Албайски. Там насчитывается 347 видов животных 75 разновидностей. В крокодиловом парке Ма-а кроме крокодилов живут еще и различные птицы, от орлов до индонезийских попугаев.
Остров Оланго называют «Птичьим островом в Центральных Филиппинах». Здесь останавливаются 50 000 птиц, мигрирующих ежегодно по восточно-азиатскому миграционному пути. В эко-парк Пайсем обитают более 80 из имеющихся в стране 1600 разновидностей бабочек и множество местных и иностранных птиц типа сов, орлов и попугаев.
Самый большой в мире орел, филиппинский орел, живет в Филиппинском Центре Исследований орлов. Филиппинский орел питается обезьянами, он является национальной птицей страны. В Центре Филиппинских Хищников в Лос Баносе стараются спасти и реабилитировать дневных и ночных хищных птиц. Здесь разводят и выращивают в неволе хищных птиц, которые подвергаются опасности вымирания и требуют сохранения, как Филиппинский Орел.
Не менее интересна и морская жизнь Филиппин. В Национальном морском парке рифа Туббатах находится 300 разновидностей кораллов из 46 родов, 71 разновидность морских водорослей. В список Мирового наследия ЮНЕСКО внесены такие обитатели филиппинских вод, как дельфины, морские черепахи и морские птицы.
Черепаховые острова – настоящий и единственный дом для черепах из юго-восточной Азии. Около острова Палаван живет «дьюгонг» или морская корова, единственное морское травоядное млекопитающее, в районе островов Донсол, Сорсогон обитают огромные китовые акулы, которых местные жители называют « butanding ».
В теплом тропическом климате Филиппин растения чувствуют себя прекрасно. В Парке Ниной Акуино и в Центре Живой природы в Куизон Авеню представлено 2 443 видов деревьев из числа тех, которые можно найти в филиппинских лесах. Еще больше растений в приюте для бабочек, эко-парке Пайсем, где растут различные деревья, в том числе и плодовые, а также множество различных цветов, включая орхидеи.
